它的口腔顶壁上有一块骨质的腭，把鼻腔和口腔隔开，它的牙齿只生在上下颌的齿槽内，而这些都和哺乳动物相似，这说明哺乳动物是由爬行动物进化来的。鳄鱼的两只眼睛长在头部的上端，它除了眼睑以外，还有透明的瞬膜，这种结构使它能适应水中的环境。
由于鳄鱼的鼻孔位于上端的背面，里面有瓣膜，所以在它潜入水中时，瓣膜自动关闭，可以防止水流入鼻孔内，在它的咽部，还有一个薄而富有弹性的膜，当这块膜一关闭，那么其口腔和呼吸道便隔开，因此，它在水中即使张大了嘴，水也不会进入呼吸道及肺部。它那长而粗的尾巴，既是游泳时的“舵”、又是捕食的工具和御敌的武器。
鳄鱼平时喜欢栖息于湖泊沼泽的滩地或丘陵山涧乱草蓬蒿中的潮湿地带。鳄鱼往往给人以行动迟钝的假象。栖息在淡水中（湾鳄可生活于海水中）。鳄鱼除少数生活在温带地区外，大多生活在热带、亚热带地区的河流，湖泊和多水的沼泽，也有的生活在靠近海岸的浅滩中。
