厦门站站房为三层建筑，局部四层，总面积8575平方米。一楼大厅高14米，净跨25米。站房东侧为700平方米的行包房(净跨20米)，西侧为700平方米的售票厅(有售票窗口9个)；二楼共设3个候车厅，中部为软席候车区，两翼东西各有700平方米的候车厅(各配有母婴候车厅)，可同时容纳乘客1500名，设有卫生间、盥洗间、盥洗台、饮水台等服务设施。
2、厦门北站，是中国铁路南昌局集团有限公司管辖的一座客运一等站。厦门北站是国家高速铁路网沿海大通道上的重要客运站之一，是一座集铁路、城市道路、长途汽车、轨道交通换乘、商业服务功能于一体的大型交通枢纽。
厦门北站的站房布局采用上进下出的格局，分成站层、站台层、高架层三个层面，与机场楼上出发层、楼下到达层的进出模式类似。出发的旅客通过高架车道直接抵达二楼的出发层，即高架层候车大厅。
