1、概念不同。商品房是由房地产开发企业开发建设并出售、出租的房屋；经适房由国家统一下达计划，用地一般实行行政划拨的方式，免收土地出让金，对各种经批准的收费实行减半征收，出售价格由政府规定。
2、建设目的不同。商品房的建设目的是为了赚取利益，而经济适用房的建设的目的是为了给一些经济困难的家庭提供保障。
3、销售价格不同。经济适用房价格自然是由政府制定，要比市面上的房屋价格低一些；而商品房是由开发企业建设的，价格自然是由企业决定。
4、物业管理费不同。商品房按物业服务的水平来收取费用，而经济适用房则由政府控制物业费。所以物业管理费偏低，但是也能够保障最基本的服务。
5、土地性质不同。经济适用房的土地通常被称为划拨用地，是由政府划拨；而商品房的用地都是通过出让的方式获得。
6、建设标准不同。商品房企业根据市场需要定位、可以采用高档设备；经适房户型、面积、档次等具有政府指导性，强调实惠。
7、产权限制不同。经济适用房的购买者拥有的是不完全产权，如果想要出让，只能在满足购买时间达到五年，并缴纳10% 的土地出让金才可以进行，而商品房就没有这样的限制。
